La marisma es un elemento de mucha relevancia en zonas costeras, asociadas a las desembocaduras de grandes ríos, son de importancia las marismas del Guadalquivir, las marismas del Guadalete, las marismas del Barbate y las marismas del Palmones en la provincia de Cádiz. Las que atañan al Pinar de la Algaida son las marimas asociadas al Guadalete en el Caño Río San Pedro, un caño con una logitud total de 25 Km que caracolea al Puerto de Santa María y a Puerto Real siriviendo como límite natural entre ambos municipios.
Una marisma es una zona que se inunda y se vacia con el nivel de las mareas, así nos encontramos grandes oscilaciones durante el año y esa vieja barca que vemos en la primera la vemos en grandes bajadas de marea al igual que con las grandes subidas se pierde el camino que circula paralelo al caño, estas situaciones extremas solo ocurren una o dos veces al año.
Paralelo al pinar y al borde del caño encontramos una pequeña franja de marisma, sin embargo al otro lado del caño encontramos una gran extensión de marisma, la Marisma de los Toruños que con una extensión de 800 Has se constituye como la marisma mejor conservada de la Bahía de Cádiz y de mayor extensión, que salvo por el carril que la atraviesa se mantiene casi virgen
La franja que transcurre paralela al pinar es pequeña pero nos permite diferenciar las tres zonas de la marisma, marisma alta; que permanece inundada durante mucho tiempo, allí encontramos Spartina maritima, Salicornia ramossisima y Sarcocornia perennis que son las plantas que soportan esa altísima salinidad, la marisma media que se encharca periodicamente pero con menos frecuencia donde hallamos Sarcocornia fruticosa, Suaeda maritima y la marisma alta que tan solo se encharca con las mareas vivas, es decir, una o dos veces al año donde encontramos Limoniastrum monopetalum, Arthrocnemum macrostachyon, Suaeda vera, Suaeda splendens o Halopeplis amplexicaulis.
En la imagen anterior vemos la marisma en invierno, cuando llega la primavera reverdece y el Salado (Limoniastrum monopetalum) tiñe de rosa la marisma dándole un aspecto mucho más vivo y atractivo. Generalmente han sido consideradas como foco de infecciones, sin embargo la gran cantidad de aves que escogen las marismas como cuarteles de invernada nos dan una idea de la productividad de alimento que presenta este ecosistema que a día de hoy sigue siendo uno de los ecosistemas más incomprendidos, a pesar de que gracias a ellos se han construido salinas que nos aportan sal y pescado de estero.
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